Chùa Trung là điểm dừng chân đầu tiên cho khách thập phương trong hành trình chiêm bái hệ thống thiền tự tại núi Bà Đen. Chùa được xây dựng từ đời các cụ Tổ khai sơn Chơn Thoại – Trừng Trùng (1879-1910) và cũng là nơi ra đời đầu tiên của lực lượng vũ trang tỉnh Tây Ninh. 

Chùa Trung sở hữu kiến trúc đặc trưng của Phật giáo miền Nam với những hoạ tiết phù điêu hoa lá, vân mây tinh tế và đặc sắc. Chùa còn có một khu vườn rộng rãi rợp bóng bồ đề, có vườn tượng kỷ niệm ngày thái tử Tất Ðạt Ða vừa mới sinh ra đã bước đi 7 bước, làm nở theo 7 đoá sen hồng và giảng đường Tâm Hoà khánh thành cuối năm 2016.

Chùa Long Châu Phước Trung hình thành từ thời các vị Tổ khai sơn về núi hành đạo. Ngày ấy, Chùa được xem là chùa Trung của Linh Sơn Tiên Thạch Tự, là nơi du khách dừng chân khi đến chiêm bái chùa Hang, chùa Bà. 

Hiện nay, chùa được trùng tu với diện mạo khang trang, Linh Sơn Thánh Mẫu được đặt tại điện thờ chính, ở vị trí cao nhất.

Chùa Linh Sơn Hoà Đồng được khôi phục lại từ một ngôi chùa cũ nơi Hòa thượng Thích Giác Điền tu tập trong những năm giữa thế kỷ 20. Với diện tích chỉ khoảng 200m2, chùa nằm biệt lập ở một góc núi Bà Đen và được xây dựng theo lối kiến trúc quen thuộc của chùa miền Nam bộ, theo cấu trúc kiểu tứ tụ (bộ khung bốn cột ở giữa) cùng 3 gian, 3 nhịp.

Ẩn dưới những tán cây rừng xanh mát, ngôi chùa là không gian an yên để hành hương chiêm bái, đồng thời có thể ngắm cảnh núi non và đồng bằng ở độ cao 350m. 

Năm 1864, thầy Huệ Mạng Kim Tiên cùng nhà sư người (họ) Chăm chọn một hang đá cách thung lũng suối Vàng khoảng 200m để tu tập và xây dựng nơi này thành Linh Sơn Long Châu tự. 

Chùa Hang gắn liền với huyền thoại “Ông đá nứt” ngay trước suối Vàng. Tương truyền trước kia, đường đến Chùa Hang rất gian nan vì có tảng đá lớn chặn, muốn đến Chùa phải đi vòng qua đường suối vô cùng khó khăn. Sư tổ Tánh Thiền đã tụng kinh cầu nguyện suốt 100 ngày thì “Ông Đá nứt đôi ra, và hai bên đá dang ra chừa một lối đi bề ngang 1,5 mét để dẫn lối vào chùa Hang”. Dấu tích ấy hiện vẫn còn, là lối đi giữa hai khối đá lớn.

Nằm ở ngay Động Ba Cô, chùa Quan Âm là ngôi chùa nằm cao nhất trong hệ thống chùa núi Bà. Từ chùa Hang, du khách phải đi qua cả trăm bậc thang với độ dốc lớn mới lên tới chùa Quan Âm.

Chùa Quan Âm có chánh điện trang nghiêm, là nơi thờ Quan Thế Âm Bồ Tát cùng Linh Sơn Thánh Mẫu Bồ Tát mặt đen đội mũ phụng, áo bào, ngồi trong tư thế kiết già thiền định trên toà sen.